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南京信帆生物:蛋白质序列分析和结构预测
更新时间:2016-05-30   点击次数:1094次

【实验目的】 
1、掌握蛋白质序列检索的操作方法; 
2、熟悉蛋白质基本性质分析; 
3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测; 
4、了解蛋白质结构预测。 
【实验内容】 
1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (ADIponectin)蛋白质序列; 
2、使用BioEdit软件对上述蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成、和疏水性等基本性质分析; 
3、对人脂联素蛋白质序列进行基于ncbi/Blast软件的蛋白质同源性分析; 
4、对人脂联素蛋白质序列进行motif结构分析; 
5、对人脂联素蛋白质序列进行二级结构和三维结构预测。 
【实验方法】 
1、人脂联素蛋白质序列的检索: 
(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez; 
(2)在Search后的选择栏中选择protein; 
(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin; 
(4)点击go后显示序列接受号及序列名称; 
(5)点击序列接受号NP_004788 (adiponectin precursor; adipose most abundant gene transcript 1

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